История Тюменской больницы начинается в далеких 1920-х годах, когда фельдшерский здравпункт Тюмени был единственным учреждением, которое оказывало медицинскую помощь речникам и их семьям. В то время в здравпункте работал всего один фельдшер.

В годы войны (1941-1945) в связи с эвакуацией в г. Тюмень Судостроительного завода расширилось количество обслуживаемого населения, увеличилось количество мест для больных, пополнился кадровый состав. А в 1962 году по причине расширения Судоремонтного завода в п. Мыс открылась поликлиника №2, рассчитанная на 300 посещений в смену.

В семидесятые годы в п. Мыс – экологически чистом районе – был открыт больничный комплекс, начал функционировать стационар на 300 коек и общепрофильная поликлиника на 576 посещений в смену. В это время был подобран новый персонал, стала развиваться научно-методическая деятельность. С 1980-х годов главным врачом больницы являлся Рыбалко Николай Павлович – заслуженный врач РФ, отличник здравоохранения, высококвалифицированный специалист. 

В 2012 году Любовь Васильевна Репетиева возглавила руководство Тюменской больницы Западно-Сибирского медицинского центра ФМБА России, взяв курс на модернизацию, на повышение качества медицинских услуг, повышение квалификации врачей, а главное – на внедрение новых медицинских технологий.

В 2016 году на должность главного врача назначен Иван Викторович Брагин.

На сегодняшний день Тюменская больница ФГБУЗ ЗСМЦ ФМБА России – это ведущее лечебное учреждение Тюмени, гарантирующее  качественное лечение в условиях комфорта и душевного отношения к каждому пациенту.

С января 2018 года главным врачом назначен Михаил Валерьевич Горбачев.

С 8 августа 2019 года главным врачом Тюменской больницы ФГБУЗ ЗСМЦ ФМБА России становится Боярская Лариса Александровна, врач-диетолог, главный внештатный специалист по диетологии ФМБА России, кандидат медицинских наук. Под ее руководством Тюменская больница наращивает показатели своей работы.